Nacido el 17 de enero de 1835 en Anyksciai (Lituania oriental) y m. el 26 de noviembre de 1902 en Seinai (Lituania meridional). Hijo de un campesino, fue durante su juventud escribiente rural, y luego frecuentó el seminario de Varniai, donde enseñó el idioma lituano.
En 1858 pasó a la Academia para sacerdotes católicos de San Petersburgo, de la cual llegó a ser profesor tras dos años de estudios en Innsbruck, Munich y Roma que siguieron a su ordenación sacerdotal (1862).
Sin embargo, como no se encontrara allí a gusto, volvió a Lituania en 1867 y enseñó en el seminario de Kaunas, del que en 1874 pasó a ser inspector. En 1883 el papa nombróle obispo auxiliar, y luego, en 1897, ocupó la sede episcopal de Seinai.
El interés de Baranauskas dirigióse, de manera preferente, hacia la filología; notable importancia para los estudios bálticos poseen sus investigaciones Textos de la Lituania oriental [Ostlitauische Texte, 1882]; Aportaciones a la dialectología lituana [Zur litauischen Dialektforschung, en Kuhns Zeitschrijt für vergleichende Sprachforschung, VIII y IX], y Anotaciones acerca del idioma y el vocabulario lituanos [Zametki o litovskom jazyke y slovare, en ruso, 1898].
La fama de Baranauskas como escritor se halla vinculada principalmente al poema El bosque de Anykscios (v.), en el que, con un profundo sentimiento de la naturaleza, lamenta la destrucción de los bosques por obra de la incesante industrialización y hace de ésta un símbolo de la decadencia del idioma lituano; la obra en cuestión se revela sensiblemente influida por El señor Tadeo (v.), de Mickiewicz.
Poesías más breves y composiciones líricas de tipo religioso aparecen reunidas en el volumen Los cantos del labrador [Artoju giesmés, 1860]. A sus impresiones, generalmente negativas, acerca de Rusia dio Baranauskas forma poética en el poema Viaje a San Petersburgo [Kelioné Petaburkan, 1859], en el que recuerda con orgullo la época (siglo XIV) durante la cual el territorio ruso pertenecía al principado lituano.